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昆明醫科大學海源學院創建于2001年，是由具有86年光榮歷史，集云南高等醫學教育、科研、醫療為一體的昆明醫科大學申辦并獲教育部批準的獨立學院。

昆明醫科大學海源學院依托昆明醫科大學優質的教學資源，雄厚的師資隊伍，秉承“海納百川，博極醫源”的校訓，近二十載艱苦創業，戮力耕耘，辦學條件不斷充實，辦學質量穩步提升，得到社會的廣泛認可和贊譽。學院現設有臨床醫學、口腔醫學、護理學、藥學、醫學影像技術、醫學檢驗技術、康復治療學、眼視光學、中藥學等24個本科專業，涵蓋醫學、理學、工學、文學、管理學、教育學等多個學科門類。其中，臨床醫學、口腔醫學、藥學、護理學專業為省級特色專業。學院已獲國家級大學生創新創業項目、國家教育部在線研究中心“國家智慧教學試點項目”、省級實驗教學示范中心、省級虛擬仿真實驗教學中心、省級教學團體、省級教學名師、省級名師工作室、省級“十二五”規劃教材、省級優秀教材、省級精品教材、省級教改研究項目、省級大學生創新創業項目、省級本科高校轉型試點院系和省廳級及其以上科研項目等120余項。學院面向全國31個省（自治區、直轄市）招生，目前本科全日制在校生達12020人。

學院現有楊林、高新兩個校區，楊林校區為主校區，2019年錄取的新生在楊林校區報到就讀。

楊林校區坐落于規劃現代的國家級產業新區滇中空港經濟區云南省嵩明職業教育基地。高新校區坐落于昆明市國家高新技術產業開發區內，西鄰名勝古跡筇竹寺與海源寺風景區，南與美麗的高原明珠滇池遙遙相望，是昆明市政府授予的“昆明市園林式單位”。

學院教學設施齊全，擁有氣勢雄偉的圖書館（配備電子閱覽室、海量文獻檢索數據庫等）、學術交流中心；設計新穎的教學樓、科研樓、綜合樓、文化藝術中心、辦公樓、標準化的塑膠田徑場。設有按現代標準化配置的先進多媒體大小教室；各專業、學科教研室、實驗室；臨床技能實驗中心（省級本科實驗教學示范中心）、口腔綜合實驗室、人體形態學陳列館、計算機室、數字化外語語音室、器械健身室、形體健美訓練室、心理咨詢室、校園廣播站、英語聽力專用無線廣播頻道、覆蓋整個校區的高速校園網絡。整齊漂亮的學生宿舍樓群、校醫院、食堂及完善的后勤服務區等，為學生的學習和生活提供了全方位的保障。

學院現設有基礎教學部、人文社科部暨馬克思主義理論教學部、第一臨床醫學系、第二臨床醫學系、醫學技術系、護理學一系、護理學二系、口腔系、文理系、公共衛生系、藥學系，擁有海源學院附屬石林天奇醫院、附屬昆明同仁醫院、附屬富民醫院和各級、各類實踐教學基地。昆明醫科大學各附屬醫院均為大型綜合“三級甲等醫院”或省級專科醫院，醫院人才集聚、設備先進、科室齊全，在省內外享有廣泛的盛譽，依托昆明醫科大學各學科專業的優質教學資源完全能滿足海源學院的教學需要，是莘莘學子理想的求學之地。

昆明醫科大學海源學院的招生計劃，由國家統一下達，招收參加全國普通高等學校統一招生考試，成績達到各省（自治區、直轄市）相應批次錄取控制線的考生（學生入學后外語教學以英語安排教學）。

昆明醫科大學海源學院，在昆明醫科大學指導下，以立德樹人為根本任務，以教學為中心，以不斷提高人才培養質量為目標，全面貫徹黨的教育方針，全面推進素質教育，培養綜合素質高、動手能力強、社會適應能力好的“本科應用型”醫藥衛生類人才。學院領導、主要干部和骨干教師由昆明醫科大學選派，教學工作嚴格按照本科專業類教學質量國家標準執行。臨床教學任務由昆明醫科大學附屬醫院和教學醫院的高水平教師承擔，臨床專業課程與昆明醫科大學臨床醫學專業同質化教學。學生合格畢業，按教育部規定，頒發統一印制、網上電子注冊、國家承認的昆明醫科大學海源學院全日制普通本科畢業證書，符合學士學位授予條件者，按照國家有關規定由昆明醫科大學海源學院頒發學士學位證書。學院設有國家獎學金、國家勵志獎學金、國家助學金、省政府獎學金、省政府勵志獎學金、院級綜合獎學金和勤工助學基金等多種獎助學金。學生畢業，享受國家普通高校畢業生就業政策，學院提前做好畢業生職業生涯規劃暨就業指導服務工作。已畢業的十二屆16243名學生的畢業證書、學士學位證書“雙證”獲得率超過99%；年終就業率超過95%；在海內外著名高校攻讀博士、碩士的海源學子已達490多人。人才培養質量的各項重要指標均屬同類院校先進行列。

學院辦學十八年來，形成了“醫藥衛生特色鮮明，專業應用性強，辦學條件好，師資力量優，管理服務信譽高，重視教育教學質量及學生全面發展”的特點，在全國、全省贏得了良好的聲譽。學院與泰國、馬來西亞等國家的高校建立了校際合作關系。學院被省教育廳評為“云南省文明學校”、“優秀普通高等學校”等。