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揭示mRNA m5C的序列結構特征和動態變化規律
目前報導的“m5C”位點往往成簇存在于高GC含量區域，對針對NSUN2的RNA干擾不敏感，也無法被m5C抗體所富集，極可能是實驗引入的假陽性。根據這一特征，該研究建立了一套新穎的生物信息學計算流程過濾噪音，得以精確地定位mRNA上的m5C。通過進一步分析，該研究發現NSUN2依賴的m5C位點傾向于擁有一個3’富G的基序，通常位于在一個小頸環結構的底部，與其tRNA底物高度一致，揭示了mRNA m5C 序列和結構特征的由來。該研究發現除了NSUN2，NSUN家族其他成員不調控mRNA m5C位點，暗示除了NSUN家族成員，可能存在新的甲基轉移酶參與了不依賴于NSUN2 的mRNA m5C位點的催化。通過進一步對7個人類組織于10個小鼠組織的轉錄組測序分析，分別確認了3212與2498個高置信度位點。結果表明，在不同組織中mRNA m5C位點的數量與甲基化水平有很大差異。在人和小鼠的睪丸、肝臟、心肌和骨骼肌，mRNA上有數百個高置信度的m5C位點，而在其他的一些組織則寥寥可數。另外，這些m5C位點在人和老鼠之間并不保守，說明它們很可能是受到順式調控（cis-regulation）的。 這項研究開發的方法為mRNA m5C的研究提供了新的工具；其構建的哺乳動物mRNA m5C 精確圖譜為發現mRNA上m5C修飾的調控和功能奠定了堅實的基礎。奧地利因斯布魯克醫科大學Alexandra Lusser教授在同期撰寫的評述文章“Getting a hold on cytosine methylation in mRNA”中，評價張銳教授課題組開發的新計算方法增加了m5C檢測的精確度，進一步提供了tRNA甲基化轉移酶NSUN2介導mRNA甲基化的令人信服的證據。
中山大學
2021-04-13
一種單鏈片段抗體-多肽融合蛋白及其應用
本發明提供了一種單鏈片段抗體-多肽融合蛋白及其應用,該蛋白是一種具有結合 Her2受體和攜帶抗癌siRNA藥物雙向功能的融合蛋白,可以作為抗癌siRNA的藥物 載體。其中,單鏈片段抗體為Her2-ScFv,多肽為魚精蛋白片段多肽。該單鏈片段抗 體-多肽融合蛋白的序列如SEQ ID NO.1所示的序列。本發明構建的Her2單鏈片段抗 體與魚精多肽的融合蛋白具有結合Her2受體和攜帶抗癌siRNA藥物的雙向功能。本 發明的融合蛋白能把抗癌siRNA藥物定向導入目標癌細胞中,開發了非病毒載體工 具,加速RNAi技術應用于臨床。
中山大學
2021-02-01
一種單鏈片段抗體-多肽融合蛋白及其應用
項目成果/簡介:本發明提供了一種單鏈片段抗體-多肽融合蛋白及其應用,該蛋白是一種具有結合 Her2受體和攜帶抗癌siRNA藥物雙向功能的融合蛋白,可以作為抗癌siRNA的藥物 載體。其中,單鏈片段抗體為Her2-ScFv,多肽為魚精蛋白片段多肽。該單鏈片段抗 體-多肽融合蛋白的序列如SEQ ID NO.1所示的序列。本發明構建的Her2單鏈片段抗 體與魚精多肽的融合蛋白具有結合Her2受體和攜帶抗癌siRNA藥物的雙向功能。本 發明的融合蛋白能把抗癌siRNA藥物定向導入目標癌細胞中,開發了非病毒載體工 具,加速RNAi技術應用于臨床。項目階段:成果已轉化
中山大學
2021-04-10
一種金槍魚骨膠原多肽的制備方法
其他成果/n一種金槍魚骨膠原多肽的制備方法，包括如下步驟：將金槍魚骨蛋白與蒸餾水混勻，并進行加熱加壓處理，得到金槍魚骨蛋白漿液；調節金槍魚骨蛋白漿液pH，并加入木瓜蛋白酶進行酶解，得到酶解液；將酶解液滅酶得到滅酶酶解液；將滅酶酶解液靜置冷卻，離心取上清液后再進行超濾處理，得膠原多肽粗液；將膠原多肽粗液依次加入到陰離子交換樹脂層析柱中洗脫，葡聚糖凝膠柱層析中洗脫，采用高效液相色譜進行純化處理，即得金槍魚骨膠原多肽。該金槍魚骨膠原多肽的制備方法，工藝安全、制備便捷。
武漢輕工大學
2021-01-12
多肽水凝膠在疫苗佐劑和抗體制備方面的應用
多肽水凝膠具有生物相容性高、可降解、具有生物活性等特點和優點，它在生長因子和藥物的緩控釋、組織工程和再生醫學等領域具有很高的應用前景。目前有較高轉化前景的項目是多肽水凝膠在疫苗佐劑和抗體制備方面的應用。癌癥、艾滋病、丙肝等重大疾病疫苗的研制具有重要的意義。在這些疾病的預防性和治療性疫苗研制中，關鍵的一環是可激活人體細胞免疫的佐劑的發現。
本項目開發出一種多肽水凝膠，具有極強地激發細胞免疫的功能。對比于現有的幾種可激活細胞免疫的佐劑（CpG，MPL 等），我們的水凝膠佐劑具有以下優勢：
1）成本低，1mgCpG 價格為 5000-8000rmb，1mgMPL 價格為 2000-4000rmb，我們的短肽實驗室合成成本 1g 低于 500rmb；
2）操作簡單，僅需物理混合就可實現與抗原復合；
3）適用于蛋白、短肽、DNA、滅活癌細胞等各類抗原，通用性高；
4）短肽結構簡單，可大量制備，實驗室一天內一次性即可合成10g 以上該多肽，可用于制備 10000 瓶以上 1mL 的水凝膠（臨床用的疫苗每次注射量是 0.5-1mL），可以很容易的實現中試級別的化合物合成及疫苗制備。基于這些優點，該佐劑具有極強的應用前景，該研究獲得科技部重大國際合作項目資助。
由于本項目的水凝膠可制備短肽抗原的抗體，它在抗體定制中具有極高的應用前景。目前抗體制備的技術為第一步將短肽連接到載體蛋白 BSA、KLH 等上，然后打動物 6-10 周。現有技術操作復雜（需偶聯蛋白）、耗時長（6-10 周），而且很多時候還未能產生有效的抗體。
我們想發展的技術相比于現有技術來說具有明顯的優勢：操作簡單，僅需物理混合短肽抗原；抗體產生迅速，4-6 周即能生成抗體；抗體滴度高，由于無需使用載體蛋白，短肽的特異性抗體滴度更高；對于磷酸化抗體來說，本項目的水凝膠能減少磷酸化短肽被體內磷酸酶去磷酸化，從而提高磷酸化短肽抗體的比例。
南開大學
2021-04-13
基于相關系數的削弱坐標時間序列中 CME 影響的方法
本發明提供了一種基于相關系數的削弱坐標時間序列中 CME 影響的方法，該方法采用基準站與普 通測站間的相關系數來表征 GPS 測站間坐標時間序列的相關程度，并且將此相關系數作為計算 GPS 測 站間共模誤差的權重。同時，未忽略 GPS 測站間的負相關性，將正相關系數和負相關系數同時納入 CME 計算體系，并且對正、負相關性同等對待，作為衡量 GPS 測站間 CME&nbs
武漢大學
2021-04-14
基于視覺特征的視頻指紋檢測及視頻序列匹配方法及系統
本發明提出一種基于視覺特征的視頻指紋檢測方法，具體為：按照幀間相關性對視頻序列分段，在分段中提取關鍵幀；在各關鍵幀中提取視頻特征；利用像素點特征字典對像素點分類；對各關鍵幀分別進行多次不同數量的分塊，在各子塊中依據像素點的分類結果統計像素點特征字典各元素的出現次數，得到該子塊的特征向量；將所有子塊的特征向量拼接得到關鍵幀的高維視頻指紋；對各高維視頻指紋進行降維；將各視頻片段關鍵幀的低維視頻指紋按照時間先后順序連成關鍵幀視頻指紋串。本發明還提供了基于上述指紋檢測方法的視頻匹配方法。本發明通過對視頻內容的關鍵信息進行有效描述，在不影響匹配率的情況下，大大降低了算法的復雜度，有效提高了檢測效率。
華中科技大學
2021-04-11
一種數控系統指令域序列異常數據檢測方法
本發明公開了一種數控系統指令域序列異常數據檢測方法，包括(1)獲取訓練樣本數據中心線，獲取包絡線比率r；(2)構造窗寬N、臨界長度X、連續異常點長度和階梯點長度分界線Y、數據流分析長度Z的經驗公式并根據經驗公式設置相應參數；(3)利用N確定滑動窗口長度，利用滑動窗口分割數據流，利用簡單移動平均法或多項式擬合法獲取滑動窗口數據中心線，包絡線外樣本為當前滑動窗口內判定的異常點存入loutlier，利用過程記錄序列lnew、過程記錄正常序列lnormal、X、Y確定最終判定類型；(4)達到指定的數據流分析長度Z時，結束異常檢查，否則清除序列號為(i-1)u+N+1、(i-1)u+N+2、...、i·u+N的數據緩存，進入第i+1個滑動窗口的分析。
華中科技大學
2021-04-14
靶向降解β-Catenin的PROTAC多肽在治療結腸癌中的應用
1. 痛點問題
Wnt/β-catenin信號通路的持續激活會導致多種癌癥的發生發展，例如結腸癌、胃癌、肝癌等。通過特異性降解β-catenin來抑制腫瘤中的Wnt信號被認為是一種最直接有效的抗癌策略。過去以β-catenin為靶點的Wnt信號抑制劑幾乎都是小分子，但小分子抑制劑很難對β-catenin進行徹底的抑制，到目前為止沒有β-catenin的小分子抑制劑被批準臨床使用。因此，開發特異性降解β-catenin的新型藥物具有極大的臨床應用價值。
2. 解決方案
本項目采用蛋白降解靶向嵌合PROTAC（Proteolysis-Targeting Chimeras）技術，將VHL泛素連接酶的配體肽段用化學合成的方法和訂書肽xStAx連接起來，得到靶向嵌合體多肽xStAx-VHL。該嵌合體多肽能夠持續穩定地降解腸癌細胞內的β-catenin蛋白，從而抑制Wnt/β-catenin信號。在小鼠的小腸類器官系統中，xStAx-VHL能夠有效地抑制類器官的存活，xStAx-VHL也能明顯的抑制結腸癌細胞在裸鼠皮下的成瘤作用，而且可以顯著減少小鼠結腸癌模型中的腫瘤數量。此外，xStAx-VHL可以通過特異性降解β-catenin來影響結腸癌患者來源的腫瘤類器官的生存。本項目首次報道了一種利用PROTAC技術合成的靶向降解β-catenin的嵌合體多肽,不僅可以在細胞內特異性降解β-catenin抑制Wnt/β-catenin信號通路，而且還能在多個腫瘤模型中抑制細胞增殖和腫瘤發生發展。
清華大學
2021-10-21
一種肝癌靶向和選擇性的抗癌小分子多肽
抗癌藥物的靶向選擇性、低耐藥性是目前抗癌藥物深度研發的難點和瓶頸。本成果發明了一種靶向腫瘤標志蛋白的小分子多肽，其不僅呈現對已篩選的肝癌、乳腺癌、前列腺癌等細胞強的抑制和殺傷作用，尤其是對肝癌呈現強的細胞選擇性，具有開發為國家注冊一類原創新藥的前景。相關工作與成果已申報國家發明專利，屬于自主知識產權和原創研發。
西南交通大學
2015-12-26