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學校創建于1947年，是抗日戰爭勝利后中國共產黨創辦的第一所醫學本科院校，曾用關東醫學院、大連醫學院、大連大學醫學院等名稱。1969年為支援“三線”建設，學校整體搬遷至貴州省遵義市，更名為遵義醫學院。2018年11月，經教育部批準，學校更名為遵義醫科大學。經過70余年的建設與發展，已成為以醫學為主，文理滲透的多學科、多層次、辦學特色鮮明、辦學實力雄厚的省屬高校，是國家衛生健康委員會(原國家衛生和計劃生育委員會)與貴州省人民政府共建高校、國家首批卓越醫生教育培養計劃項目試點高校，以優異成績通過教育部本科教學工作審核評估、口腔醫學專業認證以及臨床醫學專業認證。
學校由新蒲校區、大連路校區及珠海校區三個校區組成，占地面積約2515畝，有全日制在校生16000余人，下設28個教學院系、4所直屬附屬醫院、9所非直屬附屬醫院。
建校以來，學校群英薈萃、專家云集，生理學家沈其震院士、解剖學與人類學家吳汝康院士、微生物學家魏曦院士、藥理學家張毅教授、生理學家吳襄教授、生物學家伍律教授等知名專家學者曾執教講壇。教師隊伍中，入選第三批國家“萬人計劃”科技創新領軍人才1人，享受國務院和省政府特殊津貼專家48人，全國模范教師、全國先進工作者、全國師德先進個人、全國優秀科技工作者共6人，國家創新人才推進計劃中青年科技創新領軍人才、衛生部有突出貢獻專家、教育部新世紀優秀人才、教育部高等學校教學指導委員會委員、貴州省核心專家共16人;省級教學團隊、省部級科技創新人才團隊共22個。
學校本科教育涵蓋醫學、理學、工學、教育學、管理學、文學等6個學科門類，包含30個本科專業。有國家級特色專業4個，國家級精品課程、國家精品資源共享課、國家精品視頻公開課各1門，國家虛擬仿真實驗項目3項，國家級實驗教學示范中心2個，國家級虛擬仿真實驗教學中心1個，國家級大學生校外實踐教育基地1個。
學校從1955年開始招收研究生，是1981年恢復高考后全國首批碩士學位授權單位。1999年起與上海交通大學、重慶醫科大學、上海中醫藥大學、蘇州大學、貴州大學等高校聯合培養博士研究生。目前，研究生教育涵蓋醫學、理學、工學、法學、管理學等5個學科門類，有一級學科碩士學位授權點8個，二級學科碩士學位授權點59個，專業碩士學位授權點5個。2015年成立國際教育學院(貴州-東盟醫學教育學院)，積極發展留學生教育，國際影響力不斷提升。
學校以雙一流建設為抓手，著力強化內涵建設，臨床醫學學科2018年進入ESI全球前1%，榮獲2018年高等教育國家級教學成果獎二等獎1項，是我省近5年來唯一獲得國家級教學成果獎的高校;在貴州省“雙一流”建設中，我校藥學獲得國內一流建設學科立項，臨床醫學獲得區域內一流建設學科立項。19個項目獲貴州省一流大學(一期)重點建設項目(含培育)立項。
學校依托教育部特色民族藥國際合作聯合實驗室、基礎藥理教育部重點實驗室、省級重點實驗室、工程中心等高水平的科研平臺使科研質量與數量大幅提升。近三年獲國家自科基金項目214項，連續三年獲得貴州省科技進步一等獎3項(全省共11項)，獲二等獎2項、三等獎8項;貴州省科技成果轉化獎一等獎1項，二等獎3項。
學校不斷深化對外交流與合作，積極融入地方發展，與國內外高水平大學開展深度合作，推進協同育人;積極與大型上市企業開展科技創新、人才培養、醫療衛生等方面的合作，實現校企合作共贏。
站在新的歷史起點上，全體師生員工秉承“明德篤學，求是致用”的校訓，發揚“信念堅定、顧全大局、頑強拼搏、嚴謹治學、開拓創新”的遵醫精神，繼承學校優良傳統，突出“弘揚長征精神，注重實踐教育，培養高素質應用型人才”的辦學特色，堅持內涵發展，為早日建成西部一流的教學研究型醫科大學而努力奮斗。