一種基于交互注意力的HLA和抗原肽結(jié)合預(yù)測(cè)方法
本發(fā)明公開(kāi)了一種基于交互注意力的HLA和抗原肽結(jié)合預(yù)測(cè)方法,屬于計(jì)算生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。所示方法包括步驟1,采集HLA等位基因和獨(dú)特肽段數(shù)據(jù),構(gòu)建HLA和抗原肽結(jié)合數(shù)據(jù)集;步驟2,構(gòu)建HLA和抗原肽結(jié)合預(yù)測(cè)模型,使用所述HLA和抗原肽結(jié)合數(shù)據(jù)集對(duì)預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,獲得訓(xùn)練后的預(yù)測(cè)模型;步驟3,將HLA序列和抗原肽序列輸入預(yù)測(cè)模型,獲得HLA和抗原肽結(jié)合的預(yù)測(cè)結(jié)果。該方法將基于序列和結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)任務(wù)整合到統(tǒng)一模型中,分析預(yù)測(cè)pHLA關(guān)于序列和結(jié)構(gòu)的潛力。這種雙維度評(píng)估比現(xiàn)有方法提供了更全面的抗原免疫原性視角,為觸發(fā)免疫反應(yīng)的新抗原質(zhì)量提供了新見(jiàn)解。
南京工業(yè)大學(xué)
2021-01-12