一批潛在新冠病毒棘突蛋白抑制劑的研究
南方科技大學生物系副教授王冠宇研究團隊、醫(yī)學院教授張健研究團隊聯合深圳大學總醫(yī)院李海鷹研究團隊初步篩選出一批新型冠狀病毒棘突蛋白(spike glycoprotein)潛在抑制劑,相關成果發(fā)布在預印版平臺Research Square。 研究表明,新冠病毒利用其包膜上的棘突蛋白識別人類細胞膜受體蛋白ACE2,從而侵染人類細胞,引發(fā)嚴重的呼吸道感染癥狀。阻止病毒棘突蛋白與人類受體蛋白ACE2相互作用是研發(fā)有關藥物、抗體和疫苗的重要方向。 新冠病毒棘突蛋白抑制劑篩選策略 聯合研究團隊為加快有關抑制劑的發(fā)現,采用“老藥新用(Drug repurposing)”的策略,以公開的RBD-ACE2復合物晶體結構為靶點,通過同源建模(Homology Modeling)、計算機輔助藥物設計(Computer-aided drug design, CADD)和虛擬篩選(Virtual screening)等計算生物學方法,篩選了近15000個小分子化合物。這些化合物包含Drugbank化合物庫中所有的FDA批準藥物,以及TCMSP化合物庫中的天然活性產物。研究團隊將這些化合物與病毒棘突蛋白受體結合結構域進行分子對接,發(fā)現一批結合非常緊密的化合物,如Digitoxin,Nilotinib,Lemborexant,Raltegravir,Bisindigotin和 Evodiamine等。 Digitoxin與棘突蛋白結合模式圖 Bisindigotin與棘突蛋白結合模式圖
南方科技大學
2021-04-10