基于新一代測序的生物信息云平臺及其在科研和醫(yī)療健康領(lǐng)域的應(yīng)用
1 項目簡介本項目建立的生物云平臺,以基于 Web 的方式提供服務(wù),用戶可以輕松快速獲取服務(wù),國內(nèi)外普遍缺乏成熟的技術(shù),標(biāo)準(zhǔn)和平臺。我們首次把獨具特色的機(jī)器學(xué)習(xí)模型預(yù)測算法與最新的高通量測序方法( non-polyA RNA-seq) 相結(jié)合。我們的研究對象為長鏈非編碼 RNA( non-PolyA),目前國際上還很少有人通過高通量測序技術(shù)對疾病的 lncRNA 進(jìn)行全面預(yù)測分析和功能分類。隨著測序速度不斷提高,測序成本不斷降低,本項目將來可以發(fā)展為面向人民大眾的個性化醫(yī)療服務(wù)的平臺。 圖 1 生物醫(yī)學(xué)信息云平臺的產(chǎn)業(yè)化方向 http://www.incrna.org圖 2 生物醫(yī)學(xué)信息云平臺的應(yīng)用程序一覽 http://bioinfo.life.tsinghua.edu.cn/serve 本項目使用的核心技術(shù)“基于整合性生物信息云計算和新一代測序技術(shù)( incRNA) 的非編碼基因組疾病(如癌癥)檢測技術(shù)平臺”已經(jīng)通過軟件查新認(rèn)證( 20121022044750914)。正在準(zhǔn)備申請國家版權(quán)局軟件著作權(quán)登記證書。2 效益分析( 1)隨著新一代高通量測序技術(shù)的發(fā)展,生物信息數(shù)據(jù)爆炸式增長,數(shù)據(jù)解讀成為生物醫(yī)學(xué)研究和臨床應(yīng)用的巨大問題,我們團(tuán)隊依托清華大學(xué)生命學(xué)院魯志實驗室在生物信息學(xué),尤其是在 lncRNA 領(lǐng)域的技術(shù)專長開發(fā)的云計算平臺將為廣大科研工作和和臨床用戶提供可靠的數(shù)據(jù)分析云服務(wù),提高他們的科研效率,為科學(xué)的發(fā)展做出貢獻(xiàn)。 ( 2)我們團(tuán)隊通過與中國人民解放軍總醫(yī)院,上海肝膽醫(yī)院等十多家臨床單位的合作,將為鑒定癌癥的早期診斷和藥物治療提供新的靶點,這不僅會增強(qiáng)中國基礎(chǔ)臨床科學(xué)的發(fā)展,通過臨床應(yīng)用還會為病患者帶來癌癥早期診斷、健康管理等個性化醫(yī)療服務(wù),這將具有廣泛的社會效益。 ( 3)通過我們打造高通量測序數(shù)據(jù)分析云計算平臺和開展以癌癥早期檢測為主要內(nèi)容的個性化醫(yī)療服務(wù),將為中國培養(yǎng)一批高水平的生物信息數(shù)據(jù)分析人才,這將增強(qiáng)中國在生物信息學(xué)方面的實力。
清華大學(xué)
2021-04-13