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中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)微尺度物質(zhì)科學(xué)國家研究中心、生命科學(xué)學(xué)院陶余勇教授、李旭副教授團(tuán)隊(duì)在美國科學(xué)院院刊《PNAS》在線發(fā)表題為“Interface switch mediates signal transmission in a two-component system”的研究論文，綜合運(yùn)用生物化學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究手段，揭示了胞外G6P信號(hào)通過金黃色葡萄球菌HptRSA傳感器復(fù)合物實(shí)現(xiàn)胞內(nèi)-胞外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的結(jié)構(gòu)機(jī)制。 為了適應(yīng)不斷變化的環(huán)境，細(xì)菌必須迅速地將細(xì)胞外信息轉(zhuǎn)化為適當(dāng)?shù)募?xì)胞內(nèi)部反應(yīng)。雙組分系統(tǒng)（TCS）是原核細(xì)胞將環(huán)境刺激轉(zhuǎn)化為細(xì)胞反應(yīng)的主要信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白，它通常由膜包埋組氨酸激酶和胞質(zhì)反應(yīng)調(diào)節(jié)器組成。HptRSA是一種新近發(fā)現(xiàn)的TCS，由G6P相關(guān)傳感器蛋白（HptA）、跨膜組氨酸激酶（HptS）和細(xì)胞質(zhì)效應(yīng)器（HptR）組成。HptRSA介導(dǎo)葡萄糖-6-磷酸（G6P）攝取，支持金黃色葡萄球菌在不同宿主細(xì)胞內(nèi)的生長和增殖，但HptRSA傳感器復(fù)合物感知G6P信號(hào)并觸發(fā)下游反應(yīng)的分子機(jī)制一直以來都還是個(gè)謎。

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1 項(xiàng)目簡介本項(xiàng)目建立的生物云平臺(tái)，以基于 Web 的方式提供服務(wù)，用戶可以輕松快速獲取服務(wù)，國內(nèi)外普遍缺乏成熟的技術(shù)，標(biāo)準(zhǔn)和平臺(tái)。我們首次把獨(dú)具特色的機(jī)器學(xué)習(xí)模型預(yù)測算法與最新的高通量測序方法（ non-polyA RNA-seq） 相結(jié)合。我們的研究對(duì)象為長鏈非編碼 RNA（ non-PolyA），目前國際上還很少有人通過高通量測序技術(shù)對(duì)疾病的 lncRNA 進(jìn)行全面預(yù)測分析和功能分類。隨著測序速度不斷提高，測序成本不斷降低，本項(xiàng)目將來可以發(fā)展為面向人民大眾的個(gè)性化醫(yī)療服務(wù)的平臺(tái)。 圖 1 生物醫(yī)學(xué)信息云平臺(tái)的產(chǎn)業(yè)化方向 http://www.incrna.org圖 2 生物醫(yī)學(xué)信息云平臺(tái)的應(yīng)用程序一覽 http://bioinfo.life.tsinghua.edu.cn/serve 本項(xiàng)目使用的核心技術(shù)“基于整合性生物信息云計(jì)算和新一代測序技術(shù)（ incRNA） 的非編碼基因組疾?。ㄈ绨┌Y）檢測技術(shù)平臺(tái)”已經(jīng)通過軟件查新認(rèn)證（ 20121022044750914）。正在準(zhǔn)備申請(qǐng)國家版權(quán)局軟件著作權(quán)登記證書。2 效益分析（ 1）隨著新一代高通量測序技術(shù)的發(fā)展，生物信息數(shù)據(jù)爆炸式增長，數(shù)據(jù)解讀成為生物醫(yī)學(xué)研究和臨床應(yīng)用的巨大問題，我們團(tuán)隊(duì)依托清華大學(xué)生命學(xué)院魯志實(shí)驗(yàn)室在生物信息學(xué)，尤其是在 lncRNA 領(lǐng)域的技術(shù)專長開發(fā)的云計(jì)算平臺(tái)將為廣大科研工作和和臨床用戶提供可靠的數(shù)據(jù)分析云服務(wù)，提高他們的科研效率，為科學(xué)的發(fā)展做出貢獻(xiàn)。 （ 2）我們團(tuán)隊(duì)通過與中國人民解放軍總醫(yī)院，上海肝膽醫(yī)院等十多家臨床單位的合作，將為鑒定癌癥的早期診斷和藥物治療提供新的靶點(diǎn)，這不僅會(huì)增強(qiáng)中國基礎(chǔ)臨床科學(xué)的發(fā)展，通過臨床應(yīng)用還會(huì)為病患者帶來癌癥早期診斷、健康管理等個(gè)性化醫(yī)療服務(wù)，這將具有廣泛的社會(huì)效益。 （ 3）通過我們打造高通量測序數(shù)據(jù)分析云計(jì)算平臺(tái)和開展以癌癥早期檢測為主要內(nèi)容的個(gè)性化醫(yī)療服務(wù)，將為中國培養(yǎng)一批高水平的生物信息數(shù)據(jù)分析人才，這將增強(qiáng)中國在生物信息學(xué)方面的實(shí)力。

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