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安慶醫藥高等專科學校前身是安慶衛生學校，辦學歷史可以追溯到1943成立的“安徽省省立立煌高級助產護士職業學校”，是安徽省最早開辦的公立醫學教育學校。2007年3月，獨立升格為安慶醫藥高等專科學校，填補了皖西南醫藥高等教育空白。
學校占地面積630畝，建筑面積14萬平方米，教學儀器設備值5千余萬元。現有教職醫護員工633人。其中，教授(主任醫師)10人(二級教授1人)，副教授(副主任醫師)等副高級職稱78人，具有碩士及以上學位教師107人。省學科帶頭人1人、高職高專專業帶頭人5人、先進工作者1人、優秀教師4人、教學名師4人、教壇新秀8人，享受國務院政府特殊津貼1人、市政府特殊津貼2人。
現有臨床醫學系、藥學系、護理系、基礎醫學部、公共基礎部、思想政治理論課教學研究部以及直屬附屬醫院1所(安慶市中醫醫院)，非直屬附屬醫院3所(安慶市第一人民醫院、海軍安慶醫院、南京鼓樓醫院集團安慶石化醫院)，近200家校外實習實訓基地。開設臨床醫學、康復治療技術、醫學影像技術、醫學檢驗技術、藥學、藥品經營與管理、藥品生產技術、藥品質量與安全、中藥學、保健品開發與管理、食品營養與檢測、護理、助產等13個普通專科專業，在校生8千余人。
醫藥護主干專業已全部獲批為省級特色專業或專業綜合改革試點專業。現有央財支持的提升專業服務產業發展能力專業2個、實訓基地2個，國家“十一五”重點專科1個，省級特色專業3個、綜合改革試點專業3個、示范實驗實訓中心4個、教學團隊4個、精品課程8門、大規模在線開放課程(MOOC)5項、校企合作實踐教育基地2個、教學成果獎6項，省高等教育振興計劃重大教改項目1項，省中醫藥事業發展專項資金項目1個，市級科技成果獎1項。承擔省級自然科學、人文社科類研究項目等近50項,高職教育創新發展行動計劃(2015-2018年)24項。近年來，教師發表論文300余篇，主編或參編教材100余部，申請專利40余項，省級競賽獲獎成果35項。
學校是教育部對口支援西部教育成員單位、中國傳統醫學聯合會副會長單位、全國衛生職業教育康復技術研究會副會長單位、全國衛生高等職業教育協會常務理事單位、全國醫藥職業教育聯盟成員單位，省藥學專業技術人員繼續教育基地，市“紅十字救護培訓基地”。是連續3屆的“全國文明單位”、中華全國總工會“模范職工之家”。
辦學75年來，學校堅持“科學定位，錯位發展，提升內涵，彰顯特色”的辦學理念，已累計培養了4萬余名應用型人才。