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華南理工大學:參與繪制全球首個非人靈長類動物全細胞“地圖” 創新班學子在Nature發表論文

2022-04-18 10:26:33
華南理工大學 http://www.gxf2npi.xyz

近日,國際頂級期刊Nature在線發表題為“Celltranscriptomicatlasofthenon-humanprimateMacacafascicularis”的研究論文,發布了首個非人靈長類動物(食蟹獼猴)全身器官百萬單細胞圖譜。該圖譜將被用于物種進化、腦科學以及藥物評價和篩選等相關研究,為生物醫學的發展提供一個基礎性的資源和工具,為疾病診療、靶向藥物開發提供助力,為人類更好地探究生命的進化提供可能。

該論文的共同第一作者莊鎮堃和署名作者黃甫保錢均為華南理工大學生物科學與工程學院研究生,目前就讀于華南理工大學-深圳華大生命科學研究院基因組科學創新班。論文的共同通訊作者之一、深圳華大生命科學研究院劉龍奇研究員為學校2010屆生物技術專業校友。

莊鎮堃(左)和黃甫保錢在討論問題

據悉,該研究由深圳華大生命科學研究院聯合北京華大生命科學研究院、深圳國家基因庫、吉林大學、中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院、華南理工大學、瑞典卡羅林斯卡醫學院、英國劍橋大學、西班牙ICREA研究所、新加坡ASTAR等來自6個國家的35個科研團隊共同參與完成。

包含食蟹獼猴45個組織或器官114萬個細胞的“地圖”,“地圖”上113種顏色代表著113種細胞類型

21世紀初,人類基因組草圖的問世為生命科學的研究譜寫了一本生命“參考書”,為生命的數字化提供了基礎。然而人類對自身細胞的認識還很有限,全面解碼細胞的數字化特征將推動生命科學的研究,為生物醫學的發展提供基礎性的資源和工具。為此,研究人員將目光投向了非人靈長類中和人的基因相似度高達93%的獼猴,繪制了一張獼猴的全身器官的細胞“地圖”,這是世界上首個非人靈長類動物全身器官細胞圖譜。

利用非人靈長類細胞圖譜,研究人員找到了各個組織的共有細胞類型及其“特有標簽”(特異性標記基因),這對于了解這些共有細胞在不同組織里發揮不同功能提供了分子層面的證據。同時,基于該“地圖”,研究人員還發現了多種存在于各個組織中的具有分化潛能的細胞,這類細胞或可為之后各類器官損傷修復提供細胞來源,為哺乳動物組織再生研究提供新的思路。

基于該圖譜,研究人員還構建了包含新冠、乙肝、狂犬病毒等126種病毒易感細胞類型的病毒數據庫,這就像一本“病毒字典”,可以通過它快速查詢病毒最有可能侵染的細胞類型,同時看到該細胞類型可能分布的器官,為醫生在檢查新冠肺炎確診患者肺部情況的同時,提供其他器官例如腎臟、膽囊等針對性檢查的指導意見。

病毒易感細胞類型“字典”

“我們的研究填補了非人靈長類全身器官細胞圖譜的空缺,其數據資源會作為一個非常重要的細胞參考圖譜用于物種進化、腦科學、藥物評價和篩選以及臨床研究,”莊鎮堃介紹說,“我們還搭建了一個用戶友好的交互式網站,全世界的研究者都可以輕松訪問與下載,利用我們的數據進行更多的研究。”(圖文/莊鎮堃生物科學與工程學院編輯/孫彥東)

附:基因組科學創新班簡介

華南理工大學-深圳華大生命科學研究院基因組科學創新班于2009年3月招收首屆學生,由華南理工大學與深圳華大生命科學研究院合作共同開展本科生、研究生的聯合培養,主要面向華南理工大學所有理工類專業2年級本科生進行學生的選拔與招收。作為基因組學與生物信息學交叉學科人才培養的全新嘗試,創新班學生在雙方老師的悉心指導和華大平臺的強力支撐下實現了多項“0”的突破,形成了席卷全國的創新人才培養“華工模式”。

自創新班成立以來,已有14屆共135名華工學子加入創新班,先后共有138人次以第一作者、并列第一作者或署名作者身份在國際學術期刊上發表研究成果114篇,其中58人次以第一作者、共同第一作者或署名作者身份在Nature、Science、Cell等國際頂尖學術期刊及其子刊上發表高水平論文共43篇。

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