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揭示鈣周期素結合蛋白CACYBP促進肝癌生長增殖新機制
研究人員運用生物信息學分析疊加肝癌隊列標本驗證證實CACYBP在肝癌組織中高表達，且高表達CACYBP的肝癌病人總生存時間及無疾病進展時間更短，預后更差；而通過體外細胞實驗及小鼠模型發現缺失CACYBP的肝癌細胞株在體內和體外的生長增殖能力顯著減弱。為了研究CACYBP調控肝癌生長的分子機制，研究人員利用串聯親和純化連用質譜技術，首次鑒定出環指蛋白41（RNF41）與CACYBP相互作用，并通過泛素化實驗及放線菌酮追蹤檢測證實RNF41為CACYBP上游特異的E3泛素連接酶，在肝癌細胞中促進CACYBP的降解，且兩者在肝癌組織中的表達呈顯著負相關。進一步研究發現，CACYBP促進Ser10磷酸化使P27Kip1存留在胞漿中，從而加速細胞周期，促進肝癌細胞生長增殖，而RNF41對這一過程具有抑制作用。 該研究結合生物信息學分析、肝癌隊列標本、細胞功能及分子機制驗證，一方面揭示了CACYBP促進肝癌生長增殖的上下游分子機制，另一方面為開發新型肝癌診療靶點提供了理論依據。
中山大學
2021-04-13
具有時間分辨率的活體蛋白質激活技術
提出并發展了一種蛋白質“鄰近脫籠”策略，將可遺傳編碼的非天然氨基酸脫籠技術與計算機輔助設計篩選技術相結合，在一系列不同種類的蛋白質上實現了高時間分辨的原位激活，為在活細胞及活體動物內研究蛋白質的動態調控機制提供了一種普適性技術。利用這一被命名為 CAGE-prox 的新方法，他們建立并驗證了“激酶正交激活和信號轉導調控”、 “時間分辨的蛋白質組學分析”，“基于毒素蛋白的抗腫瘤蛋白前藥”等一系列原創應用，展示了這一化學生物學新技術在開展蛋白質動態功能研究與調控中的優勢和特色。“化學脫籠”策略，可通過對蛋白質關鍵殘基的化學保護和脫保護反應，實現對其活性的“關－開”調控（Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 129）。利用這一技術，他們先后在賴氨酸（Nat. Chem., 2014, 6, 352; Nat. Chem. Biol., 2014, 10, 1003）、酪氨酸（J. Am. Chem. Soc., 2016, 138, 15118）等天然氨基酸側鏈上實現了生物正交斷鍵反應和化學脫籠，開展了激酶等蛋白質家族的特異激活和機制研究（ACS Cent. Sci, 2016, 2, 325，ACS Cent. Sci. 2019, 5, 145）。由于細胞內蛋白質的種類繁多、活性調控機制各異，目前該方法仍受可供脫籠的氨基酸種類限制，無法適用于所有蛋白質。
北京大學
2021-04-11
自噬關鍵蛋白ATG4B抑制劑的篩選及活性
通過計算機虛擬篩選和建立熒光共振能量轉移的體外高通量篩選體系，篩選得到新型的ATG4B小分子抑制劑S130。通過對自噬信號通路的研究，發現S130不影響自噬體功能及其與溶酶體的融合，而是抑制了LC3-PE的去脂化過程，最終阻斷細胞自噬。這為進一步明確ATG4B在自噬信號通路中的調控作用提供了新的理論基礎。通過抗腫瘤作用的研究，發現S130可有效抑制結腸癌細胞的生長，且營養缺乏能進一步增強S130的抗腫瘤效果，而過表達ATG4B可部分對抗S130引起的腫瘤細胞死亡，提示ATG4B可能是腫瘤治療中的潛在靶點。同時，藥代動力學實驗結果表明，該抑制劑在體內主要分布于腫瘤組織，從而抑制結腸癌細胞的生長。綜上，該研究表明ATG4B可能是腫瘤治療的潛在藥物靶標，而S130作為高效的ATG4B小分子抑制劑具有開發成為腫瘤治療藥物的潛能。
中山大學
2021-04-13
一種C型凝集素編碼基因及其蛋白制備和應用
本發明涉及分子微生物學領域，具體的說是一種C型凝集素(C-type?lectin)及其制備和應用。C型凝集素為序列表SEQ?ID?No.1中的氨基酸序列所示。制備方法：以許氏平鮋cDNA為模板PCR擴增C型凝集素基因，構建質粒pLecC；將pLecC轉化大腸桿菌BL21Transetta(DE3)，對轉化子進行誘導表達后，收集上清，濃縮后即得重組C型凝集素。所述C型凝集素對多種弧菌具高效凝集作用，經C型凝集素處理后的細菌對許氏平鮋的侵染能力顯著降低。因此，該C型凝集素有望應用于魚類細菌性病害的防治。
青島農業大學
2021-04-13
用種子蛋白質基因工程改良超大穗小麥的品質
本項目是采用種子蛋白質基因工程手段，將富含賴氨酸的豌豆球蛋白基因（Vicilingene）轉入超大穗小麥體內并令其表達，以期大幅度提高超大穗小麥的種子蛋白質含量和賴氨酸含量，改良超大穗小麥的營養品質和加工品質，使超大穗小麥盡快成為大面積推廣種植的超高產優質小麥良種。其次，本項研究將豐富分子遺傳學理論并開辟一條高蛋白品質育種的新途徑，所
西安交通大學
2021-01-12
結核桿菌蛋白酶體調控復合體ATPase作用機理
Mpa六聚體除了與真核生物蛋白酶體調節顆粒Rpt1-Rpt6蛋白六聚體以及古細菌PAN蛋白六聚體具有一定的結構同源性之外，還具有一些明顯不同的結構特征：（1）結核桿菌Mpa具有形成雙環的兩個串聯寡核苷酸/寡糖結合（OB）結構域，而古細菌蛋白酶體相關ATPase調控顆粒（PAN）和真核生物蛋白酶體ATPase調控顆粒復合體（Rpt1-6）每個蛋白亞基都只具有單個OB結構域；（2）Mpa在具有蛋白酶體活化功能的C末端之前具有一個泛素樣的β-grasp結構域，而古細菌PAN和真核生物Rpt1-6蛋白復合體并不具有這樣的一個β-grasp結構域? 由于β-grasp結構域的存在，Mpa六聚體中各個蛋白亞基C末端被埋在結構核心中而沒有暴露在蛋白復合體結構的表面，這就影響了C末端的GQYL基序與20S 蛋白酶體復合體的對接，從而阻礙了六聚化的Mpa與七次對稱的28聚體的蛋白酶體相互作用。我們通過功能研究進一步解釋了為什么單獨的Mpa六聚體在體外情況下不能有效結合蛋白酶體核心顆粒并啟動蛋白質特異性降解，結合晶體結構域功能研究，我們提出了結核桿菌蛋白酶體ATPase調控顆粒Mpa與20S蛋白酶體復合體這一分子量超過1100KDa蛋白質機器的作用模型
南方科技大學
2021-04-13
一種靶向IRAK4蛋白降解的化合物及其應用
1.痛點問題
自身免疫系統疾病是困擾人類的一大類疾病，醫學界對其中很多種疾病的具體發病原因還所知甚少。目前的治療手段和方法也極其有限，幾乎沒有任何真正的靶向藥物和能夠根治的療法，其治療難度和患者痛苦程度都不亞于癌癥。
IRAK4是固有免疫系統上IL-1家族和TLR家族這兩大信號通路交匯的最重要的節點。IRAK4和MyD88通過形成復合物來開啟下游各種與免疫反應或細胞生長相關的基因表達。IRAK4與其他激酶不同，它既是下游信號分子的激酶，又同時起到形成復合物所必需的支架蛋白的作用。雖然，現有技術已有眾多IRAK4小分子激酶抑制劑，但它們僅可以抑制激酶本身的活性，顯示出中等的效力，無法破壞復合物的形成來徹底阻斷炎癥反應信號的產生。而PROTAC技術可通過降解靶蛋白同時阻斷IRAK4激酶活性和破壞靶蛋白支架功能，相對于常規的激酶抑制劑產生更好的抑制炎癥反應效果。
2.解決方案
本項成果涉及一類可以降解IRAK4蛋白的小分子降解劑，可以同時消除IRAK4蛋白的激酶功能和支架蛋白功能。相較于小分子抑制劑，該類小分子降解劑有更強的抑制炎癥反應的效果。有望用于開發新型、高效、新機制的抗炎小分子藥物，同時拓展該類分子在癌癥治療中的作用。
PROTAC是一種具有雙功能的雜合小分子，通過合適的連接鏈將靶蛋白配體與E3泛素連接酶配體連接，促使目的蛋白（POI）與E3連接酶形成三元復合物，從而使靶蛋白接近泛素化系統，實現靶蛋白的泛素化，隨后被蛋白酶體的26S亞基識別，最終導致靶蛋白降解。
合作需求
項目合作開發、落地空間、研發團隊或第三方資金投入。
清華大學
2022-06-07
一種消除發酵豆粕中β-伴大豆球蛋白的方法
本發明涉及一種消除發酵豆粕中β?伴大豆球蛋白的方法。該方法包括如下步驟：(1)調節豆粕的含水量在20％～25％(重量比)；(2)用110℃～125℃的蒸汽處理步驟(1)得到的豆粕，出料、冷卻；(3)對步驟(2)得到的豆粕接種酵母菌和屎腸球菌，調節接種物料的含水量在38％～42％(重量比)；(4)對步驟(3)得到的豆粕進行厭氧發酵。本發明能夠顯著地降低
中國農業大學
2021-04-14
蛋白組學直接檢測靶點活性的腫瘤伴隨診斷項目
現有伴隨診斷主要是基因檢測，而基因突變并不等于蛋白質表達，更不意味著靶點激活。本項目基于蛋白組學，特異性捕獲磷酸化酪氨酸激酶（最主要靶點），直接檢測靶點激活狀態，極低成本為腫瘤用藥提供最精準指導。
清華大學
2021-02-24
新型的G蛋白偶聯受體細胞水平篩選系統構建與應用
本發明涉及一種新型的G蛋白偶聯受體(GPCR)細胞水平篩選系統及其構建方法與應用。所述篩選系統由HEK293細胞或CHO細胞構建，含有來自以下序列中不同組間基因序列構建的2種融合表達載體：第1組：(1)DnaE基因的C端與報告基因的C端的拼接序列：DnaE-C-Report-C，(2)DnaE基因的N端與報告基因的N端的拼接序列：Report-N-DnaE-N；第2組：①GPCR基因，②β-arrestin基因。本發明的有益效果主要體現在：應用本發明篩選系統進行G蛋白偶聯受體(GPCR)細胞水平篩選，靈敏度高、特異性強，操作簡單、快速，檢測范圍廣，對任何靶細胞型中任何GPCR或GPCR信號轉導途徑的激動劑、拮抗劑都可以篩選。
浙江大學
2021-04-13