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揭示鈣周期素結(jié)合蛋白CACYBP促進(jìn)肝癌生長增殖新機(jī)制
研究人員運(yùn)用生物信息學(xué)分析疊加肝癌隊(duì)列標(biāo)本驗(yàn)證證實(shí)CACYBP在肝癌組織中高表達(dá)，且高表達(dá)CACYBP的肝癌病人總生存時(shí)間及無疾病進(jìn)展時(shí)間更短，預(yù)后更差；而通過體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)及小鼠模型發(fā)現(xiàn)缺失CACYBP的肝癌細(xì)胞株在體內(nèi)和體外的生長增殖能力顯著減弱。為了研究CACYBP調(diào)控肝癌生長的分子機(jī)制，研究人員利用串聯(lián)親和純化連用質(zhì)譜技術(shù)，首次鑒定出環(huán)指蛋白41（RNF41）與CACYBP相互作用，并通過泛素化實(shí)驗(yàn)及放線菌酮追蹤檢測證實(shí)RNF41為CACYBP上游特異的E3泛素連接酶，在肝癌細(xì)胞中促進(jìn)CACYBP的降解，且兩者在肝癌組織中的表達(dá)呈顯著負(fù)相關(guān)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，CACYBP促進(jìn)Ser10磷酸化使P27Kip1存留在胞漿中，從而加速細(xì)胞周期，促進(jìn)肝癌細(xì)胞生長增殖，而RNF41對(duì)這一過程具有抑制作用。 該研究結(jié)合生物信息學(xué)分析、肝癌隊(duì)列標(biāo)本、細(xì)胞功能及分子機(jī)制驗(yàn)證，一方面揭示了CACYBP促進(jìn)肝癌生長增殖的上下游分子機(jī)制，另一方面為開發(fā)新型肝癌診療靶點(diǎn)提供了理論依據(jù)。
中山大學(xué)
2021-04-13
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具有時(shí)間分辨率的活體蛋白質(zhì)激活技術(shù)
提出并發(fā)展了一種蛋白質(zhì)“鄰近脫籠”策略，將可遺傳編碼的非天然氨基酸脫籠技術(shù)與計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)篩選技術(shù)相結(jié)合，在一系列不同種類的蛋白質(zhì)上實(shí)現(xiàn)了高時(shí)間分辨的原位激活，為在活細(xì)胞及活體動(dòng)物內(nèi)研究蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制提供了一種普適性技術(shù)。利用這一被命名為 CAGE-prox 的新方法，他們建立并驗(yàn)證了“激酶正交激活和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控”、 “時(shí)間分辨的蛋白質(zhì)組學(xué)分析”，“基于毒素蛋白的抗腫瘤蛋白前藥”等一系列原創(chuàng)應(yīng)用，展示了這一化學(xué)生物學(xué)新技術(shù)在開展蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)功能研究與調(diào)控中的優(yōu)勢和特色。“化學(xué)脫籠”策略，可通過對(duì)蛋白質(zhì)關(guān)鍵殘基的化學(xué)保護(hù)和脫保護(hù)反應(yīng)，實(shí)現(xiàn)對(duì)其活性的“關(guān)－開”調(diào)控（Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 129）。利用這一技術(shù)，他們先后在賴氨酸（Nat. Chem., 2014, 6, 352; Nat. Chem. Biol., 2014, 10, 1003）、酪氨酸（J. Am. Chem. Soc., 2016, 138, 15118）等天然氨基酸側(cè)鏈上實(shí)現(xiàn)了生物正交斷鍵反應(yīng)和化學(xué)脫籠，開展了激酶等蛋白質(zhì)家族的特異激活和機(jī)制研究（ACS Cent. Sci, 2016, 2, 325，ACS Cent. Sci. 2019, 5, 145）。由于細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的種類繁多、活性調(diào)控機(jī)制各異，目前該方法仍受可供脫籠的氨基酸種類限制，無法適用于所有蛋白質(zhì)。
北京大學(xué)
2021-04-11
自噬關(guān)鍵蛋白ATG4B抑制劑的篩選及活性
通過計(jì)算機(jī)虛擬篩選和建立熒光共振能量轉(zhuǎn)移的體外高通量篩選體系，篩選得到新型的ATG4B小分子抑制劑S130。通過對(duì)自噬信號(hào)通路的研究，發(fā)現(xiàn)S130不影響自噬體功能及其與溶酶體的融合，而是抑制了LC3-PE的去脂化過程，最終阻斷細(xì)胞自噬。這為進(jìn)一步明確ATG4B在自噬信號(hào)通路中的調(diào)控作用提供了新的理論基礎(chǔ)。通過抗腫瘤作用的研究，發(fā)現(xiàn)S130可有效抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的生長，且營養(yǎng)缺乏能進(jìn)一步增強(qiáng)S130的抗腫瘤效果，而過表達(dá)ATG4B可部分對(duì)抗S130引起的腫瘤細(xì)胞死亡，提示ATG4B可能是腫瘤治療中的潛在靶點(diǎn)。同時(shí)，藥代動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，該抑制劑在體內(nèi)主要分布于腫瘤組織，從而抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的生長。綜上，該研究表明ATG4B可能是腫瘤治療的潛在藥物靶標(biāo)，而S130作為高效的ATG4B小分子抑制劑具有開發(fā)成為腫瘤治療藥物的潛能。
中山大學(xué)
2021-04-13
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一種C型凝集素編碼基因及其蛋白制備和應(yīng)用
本發(fā)明涉及分子微生物學(xué)領(lǐng)域，具體的說是一種C型凝集素(C-type?lectin)及其制備和應(yīng)用。C型凝集素為序列表SEQ?ID?No.1中的氨基酸序列所示。制備方法：以許氏平鮋cDNA為模板PCR擴(kuò)增C型凝集素基因，構(gòu)建質(zhì)粒pLecC；將pLecC轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21Transetta(DE3)，對(duì)轉(zhuǎn)化子進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)后，收集上清，濃縮后即得重組C型凝集素。所述C型凝集素對(duì)多種弧菌具高效凝集作用，經(jīng)C型凝集素處理后的細(xì)菌對(duì)許氏平鮋的侵染能力顯著降低。因此，該C型凝集素有望應(yīng)用于魚類細(xì)菌性病害的防治。
青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-13
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用種子蛋白質(zhì)基因工程改良超大穗小麥的品質(zhì)
本項(xiàng)目是采用種子蛋白質(zhì)基因工程手段，將富含賴氨酸的豌豆球蛋白基因（Vicilingene）轉(zhuǎn)入超大穗小麥體內(nèi)并令其表達(dá)，以期大幅度提高超大穗小麥的種子蛋白質(zhì)含量和賴氨酸含量，改良超大穗小麥的營養(yǎng)品質(zhì)和加工品質(zhì)，使超大穗小麥盡快成為大面積推廣種植的超高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)小麥良種。其次，本項(xiàng)研究將豐富分子遺傳學(xué)理論并開辟一條高蛋白品質(zhì)育種的新途徑，所
西安交通大學(xué)
2021-01-12
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結(jié)核桿菌蛋白酶體調(diào)控復(fù)合體ATPase作用機(jī)理
Mpa六聚體除了與真核生物蛋白酶體調(diào)節(jié)顆粒Rpt1-Rpt6蛋白六聚體以及古細(xì)菌PAN蛋白六聚體具有一定的結(jié)構(gòu)同源性之外，還具有一些明顯不同的結(jié)構(gòu)特征：（1）結(jié)核桿菌Mpa具有形成雙環(huán)的兩個(gè)串聯(lián)寡核苷酸/寡糖結(jié)合（OB）結(jié)構(gòu)域，而古細(xì)菌蛋白酶體相關(guān)ATPase調(diào)控顆粒（PAN）和真核生物蛋白酶體ATPase調(diào)控顆粒復(fù)合體（Rpt1-6）每個(gè)蛋白亞基都只具有單個(gè)OB結(jié)構(gòu)域；（2）Mpa在具有蛋白酶體活化功能的C末端之前具有一個(gè)泛素樣的β-grasp結(jié)構(gòu)域，而古細(xì)菌PAN和真核生物Rpt1-6蛋白復(fù)合體并不具有這樣的一個(gè)β-grasp結(jié)構(gòu)域? 由于β-grasp結(jié)構(gòu)域的存在，Mpa六聚體中各個(gè)蛋白亞基C末端被埋在結(jié)構(gòu)核心中而沒有暴露在蛋白復(fù)合體結(jié)構(gòu)的表面，這就影響了C末端的GQYL基序與20S 蛋白酶體復(fù)合體的對(duì)接，從而阻礙了六聚化的Mpa與七次對(duì)稱的28聚體的蛋白酶體相互作用。我們通過功能研究進(jìn)一步解釋了為什么單獨(dú)的Mpa六聚體在體外情況下不能有效結(jié)合蛋白酶體核心顆粒并啟動(dòng)蛋白質(zhì)特異性降解，結(jié)合晶體結(jié)構(gòu)域功能研究，我們提出了結(jié)核桿菌蛋白酶體ATPase調(diào)控顆粒Mpa與20S蛋白酶體復(fù)合體這一分子量超過1100KDa蛋白質(zhì)機(jī)器的作用模型
南方科技大學(xué)
2021-04-13
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一種靶向IRAK4蛋白降解的化合物及其應(yīng)用
1.痛點(diǎn)問題
自身免疫系統(tǒng)疾病是困擾人類的一大類疾病，醫(yī)學(xué)界對(duì)其中很多種疾病的具體發(fā)病原因還所知甚少。目前的治療手段和方法也極其有限，幾乎沒有任何真正的靶向藥物和能夠根治的療法，其治療難度和患者痛苦程度都不亞于癌癥。
IRAK4是固有免疫系統(tǒng)上IL-1家族和TLR家族這兩大信號(hào)通路交匯的最重要的節(jié)點(diǎn)。IRAK4和MyD88通過形成復(fù)合物來開啟下游各種與免疫反應(yīng)或細(xì)胞生長相關(guān)的基因表達(dá)。IRAK4與其他激酶不同，它既是下游信號(hào)分子的激酶，又同時(shí)起到形成復(fù)合物所必需的支架蛋白的作用。雖然，現(xiàn)有技術(shù)已有眾多IRAK4小分子激酶抑制劑，但它們僅可以抑制激酶本身的活性，顯示出中等的效力，無法破壞復(fù)合物的形成來徹底阻斷炎癥反應(yīng)信號(hào)的產(chǎn)生。而PROTAC技術(shù)可通過降解靶蛋白同時(shí)阻斷IRAK4激酶活性和破壞靶蛋白支架功能，相對(duì)于常規(guī)的激酶抑制劑產(chǎn)生更好的抑制炎癥反應(yīng)效果。
2.解決方案
本項(xiàng)成果涉及一類可以降解IRAK4蛋白的小分子降解劑，可以同時(shí)消除IRAK4蛋白的激酶功能和支架蛋白功能。相較于小分子抑制劑，該類小分子降解劑有更強(qiáng)的抑制炎癥反應(yīng)的效果。有望用于開發(fā)新型、高效、新機(jī)制的抗炎小分子藥物，同時(shí)拓展該類分子在癌癥治療中的作用。
PROTAC是一種具有雙功能的雜合小分子，通過合適的連接鏈將靶蛋白配體與E3泛素連接酶配體連接，促使目的蛋白（POI）與E3連接酶形成三元復(fù)合物，從而使靶蛋白接近泛素化系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)靶蛋白的泛素化，隨后被蛋白酶體的26S亞基識(shí)別，最終導(dǎo)致靶蛋白降解。
合作需求
項(xiàng)目合作開發(fā)、落地空間、研發(fā)團(tuán)隊(duì)或第三方資金投入。
清華大學(xué)
2022-06-07
業(yè)大學(xué).jpg){kind=logo}
一種消除發(fā)酵豆粕中β-伴大豆球蛋白的方法
本發(fā)明涉及一種消除發(fā)酵豆粕中β?伴大豆球蛋白的方法。該方法包括如下步驟：(1)調(diào)節(jié)豆粕的含水量在20％～25％(重量比)；(2)用110℃～125℃的蒸汽處理步驟(1)得到的豆粕，出料、冷卻；(3)對(duì)步驟(2)得到的豆粕接種酵母菌和屎腸球菌，調(diào)節(jié)接種物料的含水量在38％～42％(重量比)；(4)對(duì)步驟(3)得到的豆粕進(jìn)行厭氧發(fā)酵。本發(fā)明能夠顯著地降低
中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-04-14
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結(jié)核分枝桿菌融合蛋白 EAMMH、其構(gòu)建、表達(dá)和純化 方法及其應(yīng)用
本發(fā)明成功將 EAMM 蛋白和抗原 HspX 在基因水平進(jìn)行融合構(gòu) 建了新的融合蛋白 EAMMH，并將該不帶標(biāo)簽的融合蛋白成功進(jìn)行表 達(dá)和純化。EAMMH 融合蛋白以可溶形式表達(dá)，明顯改善了 EAMM 以包涵體進(jìn)行表達(dá)的狀況。此外，EAMMH 蛋白融合了結(jié)核分枝桿菌 主要的生長期抗原和休眠期抗原，并可誘導(dǎo)較強(qiáng)的針對(duì)各期抗原的特 異性細(xì)胞免疫和體液免疫應(yīng)答。小鼠結(jié)核分枝桿菌氣霧攻擊模型證 明，該新的融合蛋白疫苗具
蘭州大學(xué)
2021-04-14
蛋白組學(xué)直接檢測靶點(diǎn)活性的腫瘤伴隨診斷項(xiàng)目
現(xiàn)有伴隨診斷主要是基因檢測，而基因突變并不等于蛋白質(zhì)表達(dá)，更不意味著靶點(diǎn)激活。本項(xiàng)目基于蛋白組學(xué)，特異性捕獲磷酸化酪氨酸激酶（最主要靶點(diǎn)），直接檢測靶點(diǎn)激活狀態(tài)，極低成本為腫瘤用藥提供最精準(zhǔn)指導(dǎo)。
清華大學(xué)
2021-02-24