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同源染色體間的相互作用模式、三維結(jié)構(gòu)、染色質(zhì)動態(tài)、組蛋白修飾及其對基因表達(dá)的影響
該研究利用兩個不同品系小鼠雜交獲得雜交小鼠，構(gòu)建雜交小鼠父本與母本的Hi-C、ChIP-seq、RNA-seq等組學(xué)數(shù)據(jù)。根據(jù)雜交小鼠的多態(tài)位點和小鼠品系特異基因型把雜交小鼠組學(xué)數(shù)據(jù)分成父本來源基因組和母本來源基因組，這樣就可以在單倍型水平構(gòu)建三維基因組和研究基因調(diào)控。分析表明，同源染色體具有高度相似的相互作用模式，這種相互作用模式的相似性與其等位基因的共表達(dá)水平高度相關(guān)。
南方科技大學(xué)
2021-04-14
為新藥研發(fā)提供利器：復(fù)旦復(fù)雜體系多尺度研究院團(tuán)隊發(fā)表超越谷歌“AlphaFold2”的蛋白質(zhì)側(cè)鏈預(yù)測成果
在目前阿爾法折疊算法開源的情況下，復(fù)旦團(tuán)隊的算法可以為任何蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測工作提供比阿爾法折疊更準(zhǔn)確的側(cè)鏈模型，從而為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究，尤其是基于蛋白結(jié)構(gòu)的新藥設(shè)計工作提供了利器。
復(fù)旦大學(xué)
2021-12-17
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S140G 突變型 KCNQ1 蛋白及其在篩選離子通道抑制劑和 促進(jìn)劑中的應(yīng)用
本發(fā)明公開了一種突變型 KCNQ1，即 S140G-KCNQ1。還公開了利用 KCNQ1 來篩選心肌 KCNQ1 鉀離子通道的抑制劑的方法，它包括步驟：（a）將（i）表達(dá) KCNQ1 表達(dá)載體和 (ii)KCNE1 表達(dá)載體或 KCNE2 表達(dá)載體轉(zhuǎn)入哺乳動物細(xì)胞；（b）在轉(zhuǎn)化的哺乳動物細(xì)胞 的培養(yǎng)基中，添加候選物質(zhì)，并測定添加前后的電生理鉀離子流，其中，如果加入候選 物質(zhì)后的電生理鉀離子流減小，則表明該物質(zhì)是心肌 KCNQ1 鉀通道的抑制劑。該方法可 快速篩選治療房顫的候選藥物。
同濟(jì)大學(xué)
2021-04-13
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西湖大學(xué)工學(xué)院李子青團(tuán)隊 CAMEO蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽 三個月總成績?nèi)虻谝?/span>
由瑞士生物信息研究所和巴塞爾大學(xué)聯(lián)合舉辦的全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測競賽CAMEO（Continous Automated Model EvaluatiOn），與CASP（Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction）并列為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域的最重要的兩大權(quán)威競賽。
西湖大學(xué)
2022-11-29
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成功解析卡波氏肉瘤病毒（KSHV）重要功能蛋白ORF57C端（ORF57-CTD）的單體和二聚體結(jié)構(gòu)
卡波氏肉瘤病毒，又名人類皰疹病毒8型，是一種重要的人類腫瘤病毒，能導(dǎo)致卡波氏肉瘤和B細(xì)胞淋巴瘤等惡性腫瘤。ORF57是KSHV編碼的早期基因，在病毒復(fù)制過程中能穩(wěn)定病毒轉(zhuǎn)錄的mRNA從而促進(jìn)病毒復(fù)制，是病毒裂解復(fù)制過程中的重要功能蛋白。ORF57蛋白半衰期較短，因此維持其穩(wěn)定性對其發(fā)揮功能至關(guān)重要。既往報道證實ORF57蛋白通過二聚化而得以穩(wěn)定，然而ORF57二聚化的詳細(xì)生化機(jī)制長期沒有得到充分的闡明。該研究利用X射線衍射技術(shù)成功解析了ORF57-CTD蛋白3.5?分辨率的二聚體結(jié)構(gòu)和3?分辨率的單體結(jié)構(gòu)，揭示了ORF57-CTD每一個單體球狀核心區(qū)域底部都含有一個保守的鋅離子CHCC結(jié)合序列并結(jié)合一個鋅離子；此外，ORF57-CTD的每個單體N端延伸出一個長臂并包裹住另一個單體核心區(qū)域，且兩個單體的核心區(qū)域以反向平行的形式相互作用。因此，N端長臂和核心區(qū)域的相互作用介導(dǎo)了ORF57的二聚化形成
武漢大學(xué)
2021-04-10
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以靶標(biāo)蛋白甾醇14α-脫甲基酶三維結(jié)構(gòu)篩選的小分子化合物及其在制備殺菌劑中的應(yīng)用
本發(fā)明公開了以靶標(biāo)蛋白甾醇14α?脫甲基酶三維結(jié)構(gòu)篩選的小分子化合物及其在制備殺菌劑中的應(yīng)用，所述小分子化合物為((1R,5S)?3?((3?苯基?1,2,4?噁二唑?5?基)甲基)?3,4,5,6?四氫?1H?1,5?甲撐吡啶并[1,2?a][1,5]二氮環(huán)辛?8(2H)?酮鹽酸鹽。本發(fā)明通過室內(nèi)藥劑敏感性測定，證明了所述小分子化合物對引起小麥赤霉病害的主要植物病原真菌禾谷鐮刀菌具有良好的抑制活
青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
2021-01-12
浙江大學(xué)易聰課題組《Cell》合作發(fā)文發(fā)現(xiàn)新型聚集體自噬受體CCT2介導(dǎo)固態(tài)蛋白聚集體的清除
聚集體自噬是清除細(xì)胞內(nèi)毒性蛋白聚集體的重要途徑，也是治療聚集體相關(guān)疾病例如神經(jīng)退行性疾病的重要靶點。在聚集體自噬過程中，自噬體如何選擇性地識別蛋白聚集體一直是一個重要問題，而其中的機(jī)制也亟待進(jìn)一步闡明。
浙江大學(xué)
2022-04-07
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Nature Methods|郝海平/葉慧團(tuán)隊發(fā)表有關(guān)環(huán)狀亞胺離子示蹤技術(shù)揭示人類蛋白質(zhì)組存在豐富乳酰化修飾譜的研究論文
該工作針對乳酸是否可以直接共價修飾非組蛋白進(jìn)而發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)的科學(xué)問題，提出在公共的人類蛋白質(zhì)組深度測序數(shù)據(jù)中搜索乳酰化修飾的新底物蛋白的策略。
中國藥科大學(xué)
2022-07-11
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中國海洋大學(xué)與中科院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院團(tuán)隊聯(lián)合在高性能蛋白基海洋仿生材料領(lǐng)域取得重要研究進(jìn)展
研究團(tuán)隊多年來聚焦在濕環(huán)境下具有高延展性的扇貝足絲，克服了天然材料提取表征困難等技術(shù)難題，從扇貝足絲蛋白中首次報道了一種具有高延展性的纖維蛋白材料Sbp5-2，并聯(lián)合開展了材料組裝機(jī)制及應(yīng)用研究，該研究加深了對蛋白基海洋生物材料組裝分子機(jī)制的認(rèn)識，為未來開發(fā)具有自主知識產(chǎn)權(quán)的新型海洋生物醫(yī)用材料奠定了基礎(chǔ)。
中國海洋大學(xué)
2022-06-02